Author Weigend, Steffen

• 2007 | Journal Article
  ​ ​Haplotype kinship for three populations of the Goettingen minipig​
  Flury, C.; Weigend, S.; Ding, X.; Taeubert, H. & Simianer, H.​ (2007) 
  Genetics Selection Evolution, 39(2) pp. 159​-179​.​ DOI: https://doi.org/10.1051/gse:2006040 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2007 | Journal Article
  ​ ​Absence of population substructuring in Zimbabwe chicken ecotypes inferred using microsatellite analysis​
  Muchadeyi, F. C.; Eding, H.; Wollny, C. B. A.; Groeneveld, E.; Makuza, S. M.; Shamseldin, R. & Simianer, H. et al.​ (2007) 
  Animal Genetics, 38(4) pp. 332​-339​.​ DOI: https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2007.01606.x 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2008 | Journal Article
  ​ ​Mitochondrial DNA D-loop sequences suggest a Southeast Asian and Indian origin of Zimbabwean village chickens​
  Muchadeyi, F. C.; Eding, H.; Simianer, H.; Wollny, C. B. A.; Groeneveld, E. & Weigend, S.​ (2008) 
  Animal Genetics, 39(6) pp. 615​-622​.​ DOI: https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2008.01785.x 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2008 | Journal Article
  ​ ​Genetic resistance to Heterakis gallinarum in two chicken layer lines following a single dose infection​
  Gauly, M.; Kanan, A.; Brandt, H.; Weigend, S.; Moors, E. J. & Erhardt, G.​ (2008) 
  Veterinary Parasitology, 155(1-2) pp. 74​-79​.​ DOI: https://doi.org/10.1016/j.vetpar.2008.04.008 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2010 | Journal Article | 
  ​ ​Linkage disequilibrium reveals different demographic history in egg laying chickens​
  Qanbari, S.; Hansen, M.; Weigend, S.; Preisinger, R. & Simianer, H.​ (2010) 
  BMC Genetics, 11 art. 103​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2156-11-103 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2010 | Journal Article | 
  ​ ​Acute paretic syndrome in juvenile White Leghorn chickens resembles late stages of acute inflammatory demyelinating polyneuropathies in humans​
  Bader, S. R.; Kothlow, S.; Trapp, S.; Schwarz, S. C. N.; Philipp, H.-C.; Weigend, S. & Sharifi, A. R. et al.​ (2010) 
  Journal of Neuroinflammation, 7 art. 7​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1742-2094-7-7 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2010 | Journal Article
  ​ ​Assessing genetic diversity of Vietnamese local chicken breeds using microsatellites​
  Cuc, N. T. K.; Simianer, H.; Eding, H.; Tieu, H. V.; Cuong, V. C.; Wollny, C. B. A. & Groeneveld, L. F. et al.​ (2010) 
  Animal Genetics, 41(5) pp. 545​-547​.​ DOI: https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2010.02039.x 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2011 | Journal Article
  ​ ​Multiple Maternal Lineages of Vietnamese Local Chickens Inferred by Mitochondrial DNA D-loop Sequences​
  Ngo Thi Kim Cuc, N. T. K. C.; Simianer, H.; Groeneveld, L. F. & Weigend, S.​ (2011) 
  Asian-Australasian Journal of Animal Sciences, 24(2) pp. 155​-161​.​
  ​Details  WoS 

• 2011 | Journal Article
  ​ ​Conservation priorities and optimum allocation of conservation funds for Vietnamese local chicken breeds​
  Cuc, N. T. K.; Weigend, S.; Tieu, H. V. & Simianer, H.​ (2011) 
  Journal of Animal Breeding and Genetics, 128(4) pp. 284​-294​.​ DOI: https://doi.org/10.1111/j.1439-0388.2010.00911.x 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2012 | Journal Article | 
  ​ ​A High Resolution Genome-Wide Scan for Significant Selective Sweeps: An Application to Pooled Sequence Data in Laying Chickens​
  Qanbari, S.; Strom, T.-M.; Haberer, G.; Weigend, S.; Gheyas, A. A.; Turner, F. & Burt, D. W. et al.​ (2012) 
  PLoS ONE, 7(11) art. e49525​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0049525 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2012 | Review
  ​ ​Molecular tools and analytical approaches for the characterization of farm animal genetic diversity​
  Lenstra, J. A.; Groeneveld, L. F.; Eding, H.; Kantanen, J.; Williams, J. L.; Taberlet, P.& Nicolazzi, E. L. et al.​ (2012)
  Animal Genetics, 43​(5) pp. 483​-502​.​
  Wiley-blackwell. DOI: https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2011.02309.x 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2012 | Journal Article
  ​ ​Comparison of SNPs and microsatellites for assessing the genetic structure of chicken populations​
  Gaerke, C.; Ytournel, F.; Bed'hom, B.; Gut, I.; Lathrop, M.; Weigend, S. & Simianer, H.​ (2012) 
  Animal Genetics, 43(4) pp. 419​-428​.​ DOI: https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2011.02284.x 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2013 | Journal Article
  ​ ​Assessing the genetic diversity of five Tanzanian chicken ecotypes using molecular tools​
  Lyimo, C. M.; Weigend, A.; Janssen-Tapken, U.; Msoffe, P. L.; Simianer, H. & Weigend, S.​ (2013) 
  South African Journal of Animal Science, 43(4) pp. 499​-510​.​ DOI: https://doi.org/10.4314/sajas.v43i4.7 
  ​Details  DOI  WoS 

• 2013 | Journal Article | 
  ​ ​Development of a high density 600K SNP genotyping array for chicken​
  Kranis, A.; Gheyas, A. A.; Boschiero, C.; Turner, F.; Yu, L. E.; Smith, S. & Talbot, R. et al.​ (2013) 
  BMC Genomics, 14 art. 59​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2164-14-59 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2014 | Journal Article
  ​ ​Potentials of biodiversity in chickens​
  Weigend, S.; Janssen-Tapken, U.; Erbe, M.; Ober, U.; Weigend, A.; Preisinger, R. & Simianer, H.​ (2014) 
  Züchtungskunde, 86(1) pp. 25​-41​.​
  ​Details  WoS 

• 2014 | Journal Article | 
  ​ ​Population Genomic Analyses Based on 1 Million SNPs in Commercial Egg Layers​
  Gholami, M.; Erbe, M.; Gaerke, C.; Preisinger, R.; Weigend, A.; Weigend, S. & Simianer, H.​ (2014) 
  PLoS ONE, 9(4) art. e94509​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0094509 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2014 | Journal Article
  ​ ​Global diversity and genetic contributions of chicken populations from African, Asian and European regions​
  Lyimo, C. M.; Weigend, A.; Msoffe, P. L.; Eding, H.; Simianer, H. & Weigend, S.​ (2014) 
  Animal Genetics, 45(6) pp. 836​-848​.​ DOI: https://doi.org/10.1111/age.12230 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2014 | Journal Article
  ​ ​Assessment of genetic diversity and conservation priority of Omani local chickens using microsatellite markers​
  Al-Qamashoui, B.; Simianer, H.; Kadim, I. & Weigend, S.​ (2014) 
  Tropical Animal Health and Production, 46(5) pp. 747​-752​.​ DOI: https://doi.org/10.1007/s11250-014-0558-9 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2015 | Journal Article
  ​ ​Maternal genealogical patterns of chicken breeds sampled in Europe​
  Lyimo, C. M.; Weigend, A.; Msoffe, P. L.; Hocking, P. M.; Simianer, H. & Weigend, S.​ (2015) 
  Animal Genetics, 46(4) pp. 447​-451​.​ DOI: https://doi.org/10.1111/age.12304 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2015 | Journal Article | 
  ​ ​Genome Scan for Selection in Structured Layer Chicken Populations Exploiting Linkage Disequilibrium Information​
  Gholami, M.; Reimer, C.; Erbe, M.; Preisinger, R.; Weigend, A.; Weigend, S. & Servin, B. et al.​ (2015) 
  PLoS ONE, 10(7) art. e0130497​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0130497 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2015 | Journal Article | 
  ​ ​Properties of different selection signature statistics and a new strategy for combining them​
  Ma, Y.; Ding, X. D.; Qanbari, S.; Weigend, S.; Zhang, Q. & Simianer, H.​ (2015) 
  Heredity, 115(5) pp. 426​-436​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/hdy.2015.42 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2015 | Journal Article | 
  ​ ​A Scale-Corrected Comparison of Linkage Disequilibrium Levels between Genic and Non-Genic Regions​
  Berger, S.; Schlather, M.; de los Campos, G.; Weigend, S.; Preisinger, R.; Erbe, M. & Simianer, H.​ (2015) 
  PLoS ONE, 10(10) art. e0141216​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0141216 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2016 | Journal Article | 
  ​ ​Using the variability of linkage disequilibrium between subpopulations to infer sweeps and epistatic selection in a diverse panel of chickens​
  Beissinger, T. M. ; Gholami, M.; Erbe, M.; Weigend, S.; Weigend, A.; de Leon, N. & Gianola, D. S. et al.​ (2016) 
  Heredity, 116(2) pp. 158​-166​.​ DOI: https://doi.org/10.1038/hdy.2015.81 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2017 | Journal Article | 
  ​ ​Genomic Comparison of Indigenous African and Northern European Chickens Reveals Putative Mechanisms of Stress Tolerance Related to Environmental Selection Pressure​
  Fleming, D. S.; Weigend, S.; Simianer, H.; Weigend, A.; Rothschild, M.; Schmidt, C. & Ashwell, C. et al.​ (2017) 
  G3 Genes|Genome|Genetics, 7(5) pp. 1525​-1537​.​ DOI: https://doi.org/10.1534/g3.117.041228 
  ​Details  DOI  PMID  PMC  WoS 

• 2018 | Journal Article | 
  ​ ​Efficiency of different strategies to mitigate ascertainment bias when using SNP panels in diversity studies.​
  Malomane, D. K.; Reimer, C.; Weigend, S.; Weigend, A.; Sharifi, A. R. & Simianer, H.​ (2018) 
  BMC Genomics, 19(1) art. 22​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/s12864-017-4416-9 
  ​Details  DOI  PMID  PMC 

• 2019 | Journal Article | 
  ​ ​The SYNBREED chicken diversity panel: a global resource to assess chicken diversity at high genomic resolution​
  Malomane, D. K.; Simianer, H. ; Weigend, A.; Reimer, C.; Schmitt, A. O.   & Weigend, S.​ (2019) 
  BMC Genomics, 20(1) art. 345​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/s12864-019-5727-9 
  ​Details  DOI  PMID  PMC 

• 2019 | Journal Article | 
  ​ ​Genetics of adaptation in modern chicken​
  Qanbari, S.; Rubin, C.-J.; Maqbool, K.; Weigend, S.; Weigend, A.; Geibel, J.   & Kerje, S. et al.​ (2019) 
  PLOS Genetics, 15(4) art. e1007989​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1007989 
  ​Details  DOI  PMID  PMC 

• 2020 | Journal Article
  ​ ​Improving Imputation Quality in BEAGLE for Crop and Livestock Data​
  Pook, T.; Mayer, M.; Geibel, J. ; Weigend, S.; Cavero, D.; Schoen, C. C. & Simianer, H. ​ (2020) 
  G3: Genes, Genomes, Genetics, 10(1) pp. 177​-188​.​ DOI: https://doi.org/10.1534/g3.119.400798 
  ​Details  DOI 

• 2020 | Preprint
  ​ ​How Array Design affects SNP Ascertainment Bias​
  Geibel, J.; Reimer, C.; Weigend, S.; Weigend, A.; Pook, T.& Simianer, H.​ (2020). DOI: https://doi.org/10.1101/833541 
  ​Details  DOI 

• 2020 | Journal Article | 
  ​ ​Bone Health or Performance? Adaptation Response of Genetically Divergent Chicken Layer Lines to a Nutritive Calcium Depletion​
  Jansen, S.; Bues, M.; Baulain, U.; Habig, C.; Halle, I.; Petow, S. & Sharifi, A. R.  et al.​ (2020) 
  Animals, 10(9) pp. 1645​.​ DOI: https://doi.org/10.3390/ani10091645 
  ​Details  DOI 

• 2020 | Journal Article | Research Paper | 
  ​ ​Assessing breed integrity of Göttingen Minipigs​
  Reimer, C.; Ha, N.-T.; Sharifi, A. R. ; Geibel, J. ; Mikkelsen, L. F.; Schlather, M. & Weigend, S. et al.​ (2020) 
  BMC Genomics, 21(1) art. 308​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/s12864-020-6590-4 
  ​Details  DOI 

• 2020 | Journal Article | 
  ​ ​Relationship between Bone Stability and Egg Production in Genetically Divergent Chicken Layer Lines​
  Jansen, S.; Baulain, U.; Habig, C.; Weigend, A.; Halle, I.; Scholz, A. M. & Simianer, H.  et al.​ (2020) 
  Animals, 10(5) pp. 850​.​ DOI: https://doi.org/10.3390/ani10050850 
  ​Details  DOI 

• 2020 | Journal Article | 
  ​ ​Egg Production and Bone Stability of Local Chicken Breeds and Their Crosses Fed with Faba Beans​
  Nolte, T.; Jansen, S.; Halle, I.; Scholz, A. M.; Simianer, H. ; Sharifi, A. R.   & Weigend, S.​ (2020) 
  Animals, 10(9) pp. 1480​.​ DOI: https://doi.org/10.3390/ani10091480 
  ​Details  DOI 

• 2020 | Journal Article | Erratum | 
  ​ ​Correction: Jansen, S., et al. Relationship between Bone Stability and Egg Production in Genetically Divergent Chicken Layer Lines. Animals 2020, 10, 850​
  Jansen, S.; Baulain, U.; Habig, C.; Weigend, A.; Halle, I.; Scholz, A. M. & Simianer, H.  et al.​ (2020) 
  Animals, 10(12) pp. 2355​.​ DOI: https://doi.org/10.3390/ani10122355 
  ​Details  DOI 

• 2020 | Journal Article | Research Paper | 
  ​ ​Growth Performance of Local Chicken Breeds, a High-Performance Genotype and Their Crosses Fed with Regional Faba Beans to Replace Soy​
  Nolte, T.; Jansen, S.; Weigend, S.; Moerlein, D. ; Halle, I.; Link, W.   & Hummel, J.  et al.​ (2020) 
  Animals, 10(4) pp. 702​.​ DOI: https://doi.org/10.3390/ani10040702 
  ​Details  DOI 

• 2020 | Journal Article | Research Paper | 
  ​ ​Meat Quality Parameters and Sensory Properties of One High-Performing and Two Local Chicken Breeds Fed with Vicia faba​
  Escobedo Del Bosque, C. I.; Altmann, B. A. ; Ciulu, M. ; Halle, I.; Jansen, S.; Nolte, T. & Weigend, S. et al.​ (2020) 
  Foods, 9(8) pp. 1052​.​ DOI: https://doi.org/10.3390/foods9081052 
  ​Details  DOI  PMID  PMC 

• 2021 | Journal Article | Research Paper | 
  ​ ​How array design creates SNP ascertainment bias​
  Geibel, J.; Reimer, C.; Weigend, S.; Weigend, A.; Pook, T. & Simianer, H.​ (2021) 
  PLoS One, 16(3) pp. e0245178​.​ DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0245178 
  ​Details  DOI 

• 2021 | Journal Article | Research Paper | 
  ​ ​Genotypic and Dietary Effects on Egg Quality of Local Chicken Breeds and Their Crosses Fed with Faba Beans​
  Nolte, T.; Jansen, S.; Weigend, S.; Halle, I.; Simianer, H. ; Sharifi, A. R.   & Mörlein, D. ​ (2021) 
  Animals, 11(7) pp. 1947​.​ DOI: https://doi.org/10.3390/ani11071947 
  ​Details  DOI 

• 2021 | Journal Article | Research Paper | 
  ​ ​Genetic diversity in global chicken breeds in relation to their genetic distances to wild populations​
  Malomane, D. K.; Weigend, S.; Schmitt, A. O.; Weigend, A.; Reimer, C. & Simianer, H.​ (2021) 
  Genetics Selection Evolution, 53(1) art. 36​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/s12711-021-00628-z 
  ​Details  DOI 

• 2021 | Journal Article | 
  ​ ​Identification and Functional Annotation of Genes Related to Bone Stability in Laying Hens Using Random Forests​
  Jansen, S.; Baulain, U.; Habig, C.; Ramzan, F.; Schauer, J.; Schmitt, A. O.   & Scholz, A. M. et al.​ (2021) 
  Genes, 12(5).​ DOI: https://doi.org/10.3390/genes12050702 
  ​Details  DOI 

• 2021 | Journal Article | Research Paper | 
  ​ ​How imputation can mitigate SNP ascertainment Bias​
  Geibel, J.; Reimer, C.; Pook, T.; Weigend, S.; Weigend, A. & Simianer, H.​ (2021) 
  BMC Genomics, 22(1) art. 340​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/s12864-021-07663-6 
  ​Details  DOI 

• 2022 | Journal Article | Research Paper
  ​ ​Assessment of linkage disequilibrium patterns between structural variants and single nucleotide polymorphisms in three commercial chicken populations​
  Geibel, J.; Praefke, N. P.; Weigend, S.; Simianer, H. & Reimer, C.​ (2022) 
  BMC Genomics, 23(1) art. 193​.​ DOI: https://doi.org/10.1186/s12864-022-08418-7 
  ​Details  DOI 

Researcher

Sort

Items per Page